Algumas apps nativas do os não iniciam

Olá, preciso de ajuda.

Eu tenho o Ubuntu Mate 18.04 Bionic Beaver x64, e um dia tinha ido a app de configuração do menu para tirar algumas aplicações do sistema que não precisava, apliquei as definições e o pc pediu-me para reiniciar. Reiniciei e vi que o menu do sistema estava igual e então fui outra vez para as definições do menu, mas não abriu nunca mais, até reiniciei outra vez, porque podia ser o sistema que não reiniciou bem da 1ª vez, fui ver o menu e só tinha o separador de definições. Dessa altura para cá tenho de abrir as apps apartir da dock ou no terminal. Este foi só um dos exemplos, o vlc ficou todo alterado, o firefox demorava mil anos para abrir, a Software Boutique não abre, e além disso caja estava sempre a travar. Já atualizei para a versão 19.04, e ficou tudo na mesma.

Por vavor se alguém tiver uma solução diga porque não cria trocar de so, porque além de dar uma trabalheira, gosto muito e acho muito produtivo este sistema! Obrigado!